Projet de cours en bioinformatique

C’était mon tout premier projet sérieux en biologie computationnelle, où j’ai eu une expérience pratique à la fois dans le développement logiciel et dans l’analyse de données biologiques.
Dans le cadre du programme de la Faculté de Bio-ingénierie et Bioinformatique de l’Université d’État de Moscou, j’ai développé un site web étudiant et abordé plusieurs domaines de la bioinformatique, tels que :

• l’analyse de séquences d’ADN, ARN et protéines ;
• l’alignement multiple de séquences ;
• la construction d’arbres phylogénétiques ;
• l’interaction avec les bases de données biologiques (GenBank, UniProt, PDB) ;
• la prédiction de structure des protéines ;
• l’annotation génomique ;
• le traitement des données biomédicales textuelles et numériques.

Le projet utilisait Java et Perl pour le scripting, les parsers, les outils d’analyse, ainsi que HTML/CSS pour la création du site web.
Ce fut une expérience complète, où j’ai dû :

• concevoir la structure et l’interface du site ;
• écrire la logique backend avec Perl/CGI ;
• traiter les fichiers FASTA et les sorties BLAST ;
• intégrer des ressources bioinformatiques externes ;
• visualiser les résultats analytiques.

🔗 Site étudiant (souvenir numérique de 2007)

Oui, le design est préhistorique — mais bon, ça passait crème pour l’époque 😉